炎帝遍尝百草，身中剧毒。而蚩尤、刑天、雨师和风伯已经组织了妖魔军队，意图推翻炎帝，夺取大荒统治权。炎帝于是向黄帝轩辕氏求助，共同抵抗妖魔。黄帝手下有应龙、女魃两员大将。黄帝还得到了九天玄女传授的三卷天书和风后传授的八阵图，大将应龙用八阵图训练士兵，建立了天机营；女魃用三卷天书教授弟子，建立了云麓仙居。炎黄和蚩尤之战终以炎黄的胜利而终结，蚩尤被杀死，其魂魄被分散封印于大荒各地。雨师和风伯带领残余的妖魔部队逃入幽都。刑天被斩首后却屹立不到，还舞动着巨斧和盾牌进行抵抗。

经过这场大战，幽都至恶之气的影响却并未消除，不仅世间生灵遭受毒害，昆仑山上的异兽也常常受到感染。西王母于是移昆仑山于幽都之上，镇守幽都。帝俊则派出司幽设下太古铜门，并请十二上仙在门上设立天元地极锁，封印了太古铜门，幽都乃与大荒世界隔绝。位居十二上仙之首的广成子游历大荒，在巴蜀锁妖塔发现了另一个通往幽都的裂口，于是建立了弈剑听雨阁，由门下弟子负责镇守这个裂口。

黄帝传帝位于少昊，少昊传帝位给颛（zhuan）顼（xu），颛顼将帝位传给了帝喾（ku），帝喾之后又传帝位给尧。

在尧统治的时代，火神祝融与水神共工发生了一场恶战，共工力敌不过，就一头撞向不周山，不周山是昆仑山的一部分，不周山折断，整个大荒世界发生了翻天覆地的变化。不周山的碎片落在大地上，燃起无法熄灭的熊熊大火。天空倾斜，下起了倾盆大雨。而昆仑山的震动，造成了幽都的再次活动，太古铜门产生了裂痕，幽都之气泄漏出来。整个大荒陷入了前所未有的危机中。

西王母指派火神祝融熄灭大火，于是祝融拾起散落的不周山碎片，堆放在九黎山间，成为了永不熄灭的火山。而崇拜祝融的百姓依山建立了荒火教派，供奉火神祝融。