拿破伦最担心的就是俄军。他命令缪拉、苏尔特、达武、莫蒂埃(第四军团的指挥官)和拉纳追踪库图佐夫和残余的奥军以防他们和沙皇亚历山大的军队会合。同时，如果沙皇军队和200，000人的普鲁士军会合，法军将受到俄普奥三军的围攻。而经过连场大战后的法军现在也只有25万人了，幸好第四军团和第九军团已经赶到战场，要不然拿破伦的兵力将更加的捉襟见肘。拿破伦冷静地判断了形势：即使普军会同俄军作战，调动庞大的军队也不是朝夕能成之事；也就是说，可以在俄军和奥军或普军会合之前先吃掉俄军。拿破伦准备将俄、奥、普三军一个一个吃掉，因此他当机立断，力求赶在普鲁士参战前占领维也纳，切断俄军退路——在查理大公率领奥军赶回奥地利之前，把这支俄军包围并消灭在多瑙河以南地区。

位于巴伐利亚的奥格斯堡现在成了法军的主要后方供给地，拿破伦命令贝尔蒂埃将慕尼黑变成战争指挥中心。还有一个很严重的问题困绕着拿破伦，那就是初冬的暴风雪和严寒已经降临，但是法国军人身上穿的仍然是8月从英吉利海峡转移时穿的衣服。由于后勤运输不足的原因，如果不能在寒冬来临之前击败敌军的话，那么法军就很可能输掉这场战争。

为了迅速占领维也纳，抢占奥地利的各种物资，10月22日拿破伦命令休整了两天的各军团迅速向维也纳推进，并且要求欧仁的意大利方面军进攻奥地利南部，尽可能的多牵制一些奥军，以减轻法军的压力。