尽管由于陈永华的再三劝谏，冯锡范一案最终没有牵涉太广，但郑克臧的一系列动作还是震动了东宁政坛。为安抚人心，在郑省英的建议下，郑克臧拜郑聪为辅弼将军，拜郑明为匡政将军，这两人自然明白郑克臧的心意，因此以郑温、郑宽、郑智的遭遇为戒，除了偶尔在朝会上充当门神以外，郑克臧即便相召也托故不朝。

除了任命郑氏宗亲辅政以外，郑克臧还对东宁现行的爵位体系做了改动，在明制原本的公、侯、伯三等之外，按卫所世官制度的指挥使、指挥同知、指挥佥事、正千户、副千户、卫镇抚、百户、试百户、所镇抚等九等计爵。[.]

其中公侯伯三等均为世爵，而指挥使以下九等为显爵，世爵传承、显爵荣身。除了之前已经授予的侯爵、伯爵以外，今后再要授爵必先从所镇抚开始授起，逐次递转直至世爵，世爵非绝嗣或大罪不除永为东宁屏障。

虽说东宁各爵均不授土，自所镇抚以上只是按各爵位级领有的食邑数目折算薪俸（注：宋制，一户实封折三百文一年），但由于郑克臧宣布而今正在与清虏隔海对峙因此民政财税也算军功，因此这一次自陈永华、郑省英以降共册封了包括两个指挥使、十一个指挥使同知、十八个指挥使佥事在内的一百三十二员显爵，这就让原本没有希望成为世爵的众官对未来也生出了不小的希望来。

然而这么一来童子军中原本沿用的卫所官制就需要变动了。于是郑克臧顺势自超品的招讨大将军之下，以历代武散官及明代武勋官为基础设置了包括正一品的上将军、从一品的将军、正二品的副将军、从二品的轻车都尉、正三品的骑都尉、从三品的骁骑尉、正四品飞骑尉、从四品云骑尉、正五品的武骑尉、从五品昭信校尉、正六品承信校尉、从六品忠显校尉、正七品忠武校尉、从七品的护军校尉、正八品的修武校尉、从八品的保义校尉、正九品的进义校尉、从九品的敦武校尉等新式军阶。譬如刘国轩，他的官爵若用新的说法就变成了金吾上将军（明郑正一品武官军阶）、后军都督府左都督（明室正一品武官官阶）、总督水陆两师（实职差遣）、武平伯（爵位）。

由于只是改动了军阶名目并不影响郑军旧有的镇将、协统、领班的体制，所以这番改革便很顺利的就被推行了下去，即便有少数有异议的，在一众大佬被新的爵法撩拨的双眼发赤的情况下，也很快沉默下去了。

不过更让全台文武振奋的是，郑克臧宣布原来分给各家的文武官田一律变为私有，代价是所以原本租种官田的佃户将由官中统一授田分遣到凤山、诸罗拓殖，而因此出现的劳力缺口则由官中提供更为廉价的黑奴来弥补。